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세무조사 사전통지 생략, 조사권 남용 판결로 본 기업의 세금 방어 전략 본문

세금 소식

세무조사 사전통지 생략, 조사권 남용 판결로 본 기업의 세금 방어 전략

국세청24년조사국출신/상속증여양도자금출처법인조사기장대리 2025. 9. 6. 09:10

 

 

 

 

세무조사는 납세자의 세금 신고에 탈루나 오류가 있는지 확인하기 위한 중요한 절차입니다. 그러나 세무당국이 법이 정한 절차를 위반하거나 무리하게 조사 범위를 넓히면, 해당 과세는 취소될 수 있습니다. 최근 서울행정법원의 판결은 이러한 점을 명확히 보여주는 대표 사례입니다.

 

서울지방국세청은 제약회사 A사를 상대로 2014~2019 사업연도에 걸친 법인세 세무조사를 진행했습니다. 그러나 사전통지 절차를 생략했고, 조사 범위를 정당한 사유 없이 확대했습니다. 결국 법원은 “세무조사권 남용에 따른 과세는 위법하다”며 원고의 손을 들어줬습니다.

 

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주요 쟁점

 

① 사전통지 생략의 위법성

세무조사 사전통지는 납세자의 권리 보장을 위한 필수 절차입니다. 예외 규정이 있더라도 명확한 사유가 입증되어야 하는데, 이번 사건은 그 요건을 충족하지 못했습니다.

 

② 조사 범위 확대 문제

본래 쟁점이던 심포지움 비용 외에 연구비, 인력개발비 등 다른 영역까지 확대 조사한 것은 "최소성 원칙" 위반으로 인정되었습니다.

 

③ 위법한 자료로 인한 과세 무효

조세법률주의에 따라 절차적 위법은 곧바로 과세 무효로 이어질 수 있습니다. 이는 납세자에게 중요한 방패 역할을 합니다.

 

◆ 기업의 대응 전략

 

① 세무조사 개시 통지를 받을 경우 절차 위반 여부를 반드시 확인해야 합니다.

② 조사 범위가 본래 취지와 다르게 확대된다면 전문가와 함께 합법성 검토를 진행해야 합니다.

③ 세 처분을 받았다면 무조건 수용하기보다 불복 절차를 통해 방어할 수 있습니다.

이번 판례는 단순한 사건을 넘어 모든 기업에게 "세무조사 절차를 주의 깊게 살펴야 한다"는 경각심을 주고 있습니다.

 

 

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· 서울지방국세청 조사3국 (상속,자금출처, 주식변동,법인조사)

· 강남세무서 재산팀장 (양도세,상속세.증여세 조사실무)

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